Bødkergården er en selvejende integreret institution. 

Den selvejende daginstitutions ledelse består af en bestyrelse, der varetager den overordnede ledelse, og en leder, der under ansvar overfor bestyrelsen varetager den pædagogiske og administrative ledelse, personaleforhold og daglige drift af daginstitutionen.

Bestyrelsen består af 7 medlemmer, 6 medlemmer valgt af forældrene og 1 medlem valgt af personalet.